Eté 1950. Entre les murs délabrés du manoir familial de Buckshaw, la jeune Flavia de Luce consacre son temps à ses deux passions, la chimie et l'étude des poisons. Son quotidien est alors bouleversé par une série d'événements mystérieux, à commencer par la découverte d'un oiseau mort, sur le bec duquel est empalé un étrange timbre. Bientôt, elle est témoin de la mort d'un homme dans son potager.